Ahmad Mustofa, KH Drs. SH lahir di Magelang, 8 Agustus 1944 adalah Pimpinan Umum Pondok Pabelan. Satu-satunya adik kandung KH Hamam Dja’far. Pendidikannya setelah menyelesaikan SR Muntilan I tahun 1957 melanjutkan di Madrasah Mu’allimin Muhammadiyah Yogyakarta hingga tamat tahun 1963. Kemudian mengikuti kuliah di Fakultas Syariah IAIN Yogyakarta (lulus 1971), serta kuliah pula di Fakultas Hukum Universitas Muhammadiyah Yogyakarta (lulus 1991). Selain aktif berkegiatan di Pondok Pabelan juga menjadi Hakim di Pengadilan Agama Magelang (1976-1982), Ketua Pengadilan Agama (PA) Kebumen, Kendal dan Kota Mungkid (1982-2002), serta Hakim Tinggi di Pengadilan Tinggi Agama Yogyakarta (2002-2008). Suami Hj. Nunun Nuki Aminten, alumnus Pondok Pabelan dan bapak dari lima orang anak, yakni Ririn Suni Amarini (wafat masih kecil), Muhammad Adi Sunata (35), Muhammad Rosyid Budiman (32), Muhammad Citradi (28), serta yang bungsu Muhammad Ciptadi (24).