Lembaga ini merupakan wujud kepedulian Pesantren terhadap masyarakat sekitar, yang dires- mikan oleh Pimpinan Pondok Pesantren Pabelan untuk melayani kesehatan santri dan masyarakat.

Terletak disebelah utara gedung Balai Peng- kajian dan  Pengembangan  Masyarakat (BPPM), menyediakan pelayanan kesehatan antara lain po- liklinik ; kesehatan ibu dan anak ; ruang bersalin.

Selain BKSM yang menyediakan pelayanan untuk  santri  dan  masyarakat, Bagian Kesehatan OPPP juga ikut bergerak dalam bidang kesehatan santri dan masyarakat dengan menyediakan obat– obatan ringan sebagai langkah pertama  penang- gulangan penyakit . Sedangkan untuk obat-obatan secara umum dan vitamin–vitamin disediakan langsung oleh Koperasi Pelajar.